Protein–RNA interactions for Protein: A6NLF2

ELOA3D, Elongin-A3 member D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3DA6NLF2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELOA3DA6NLF2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELOA3DA6NLF2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELOA3DA6NLF2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms