Protein–RNA interactions for Protein: A6NKU9

SPDYE3, Speedy protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE3A6NKU9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPDYE3A6NKU9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPDYE3A6NKU9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPDYE3A6NKU9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPDYE3A6NKU9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms