Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCCD1A6NED2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCCD1A6NED2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCCD1A6NED2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms