Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALM3A6NDB9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PALM3A6NDB9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALM3A6NDB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms