Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRD1A4D1F6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRD1A4D1F6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms