Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf170A2RU37 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf170A2RU37 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms