Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRGMA1A4Y4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms