Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F8A0AVK6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F8A0AVK6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms