Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCRBV5S2A0A599 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCRBV5S2A0A599 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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