Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQU0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQU0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQU0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQU0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQU0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQU0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQU0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQU0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQU0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQU0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQU0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PQU0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PQU0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms