Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms