Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TMEM9-205ENST00000414605 545 ntTSL 211.05□□□□□ -0.642e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TBC1D14-204ENST00000439515 602 ntTSL 510.84□□□□□ -0.672e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 IWS1-203ENST00000412979 441 ntTSL 310.53□□□□□ -0.722e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMX3-201ENST00000299608 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.782e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMEM9-208ENST00000472411 2892 ntTSL 210.1□□□□□ -0.792e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.822e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.842e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 RIF1-202ENST00000414861 2534 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.962e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.092e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 RIF1-211ENST00000494333 743 ntTSL 38.11□□□□□ -1.112e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.162e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.172e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.192e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.232e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 ATP6V0A2-208ENST00000545059 4232 ntTSL 57.36□□□□□ -1.232e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.372e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.392e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 IWS1-212ENST00000637187 1021 ntTSL 56.05□□□□□ -1.442e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMX3-206ENST00000564631 1509 ntTSL 1 (best)5.84□□□□□ -1.472e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.592e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 PDS5A-210ENST00000513798 494 ntTSL 33.65□□□□□ -1.832e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 NCL-210ENST00000494618 910 ntTSL 26.84□□□□□ -1.315e-20■■□□□ 12
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TARDBPQ13148 LDHB-201ENST00000350669 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -16e-22■■□□□ 12
TARDBPQ13148 LDHB-206ENST00000470985 678 ntTSL 1 (best)7.62□□□□□ -1.196e-22■■□□□ 12
TARDBPQ13148 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.581e-10■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-10■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 SET-205ENST00000409104 962 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.021e-10■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 SET-202ENST00000372686 1029 ntTSL 24.98□□□□□ -1.611e-10■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.931e-10■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.374e-6■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 LMAN2-207ENST00000514458 616 ntTSL 521.14■□□□□ 0.974e-6■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.724e-6■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 LMAN2-202ENST00000502560 876 ntTSL 319.42■□□□□ 0.74e-6■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 LMAN2-206ENST00000513877 823 ntTSL 216.74■□□□□ 0.274e-6■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 LMAN2-205ENST00000506310 564 ntTSL 414.02□□□□□ -0.174e-6■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.853e-9■■□□□ 11.9
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TARDBPQ13148 HNRNPH3-206ENST00000478698 1507 ntTSL 213.92□□□□□ -0.182e-13■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.032e-11■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.622e-11■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.092e-11■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 TMEM41B-201ENST00000299596 1443 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.162e-11■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 TMEM41B-202ENST00000524543 3848 ntTSL 211.49□□□□□ -0.572e-11■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.952e-7■■□□□ 11.9
TARDBPQ13148 MBNL1-210ENST00000461436 1681 ntTSL 55.43□□□□□ -1.541e-6■■□□□ 11.8
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TARDBPQ13148 RBCK1-210ENST00000441733 961 ntTSL 517.29■□□□□ 0.364e-6■■□□□ 11.8
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TARDBPQ13148 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.014e-6■■□□□ 11.8
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TARDBPQ13148 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.134e-6■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 ZNF644-211ENST00000498303 514 ntTSL 1 (best)14.16□□□□□ -0.144e-6■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.944e-6■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.444e-6■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 ZNF644-205ENST00000467231 851 ntTSL 34.49□□□□□ -1.694e-6■■□□□ 11.7
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TARDBPQ13148 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.644e-8■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-8■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 KMT2E-214ENST00000495267 1133 ntTSL 1 (best)20■□□□□ 0.792e-6■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 KMT2E-206ENST00000474203 617 ntTSL 39.59□□□□□ -0.872e-6■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 CDCA5-209ENST00000531401 858 ntTSL 514.03□□□□□ -0.162e-8■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 CDCA5-204ENST00000479032 1004 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.182e-8■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 KEL-203ENST00000465697 501 ntTSL 39.65□□□□□ -0.862e-8■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 CD3EAP-201ENST00000309424 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.872e-8■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.464e-6■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.24e-6■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 RPS6KB1-205ENST00000472940 2808 ntTSL 213.41□□□□□ -0.264e-6■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.564e-6■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 RPS6KB1-201ENST00000225577 5375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.934e-6■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.224e-6■■□□□ 11.7
TARDBPQ13148 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.75■■■□□ 2.033e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SUZ12P1-201ENST00000497969 886 ntTSL 1 (best)25.07■■□□□ 1.63e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.083e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 221.8■■□□□ 1.083e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 13e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.853e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.823e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 CTNNA1-213ENST00000519113 859 ntTSL 319.72■□□□□ 0.753e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.683e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.683e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.673e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.563e-6■■□□□ 11.6
TARDBPQ13148 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.483e-6■■□□□ 11.6
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