RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495267.5

KMT2E-214, Transcript of lysine methyltransferase 2E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KMT2E, Length 1,133 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KMT2E-214ENST00000495267 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.58■■■■■ 5.53
KMT2E-214ENST00000495267 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.18■■■■■ 4.66
KMT2E-214ENST00000495267 ABCC9O60706 1549 aa43.3■■■■■ 4.52
KMT2E-214ENST00000495267 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.6■■■■■ 4.25
KMT2E-214ENST00000495267 NACADO15069 1562 aa41.54■■■■■ 4.24
KMT2E-214ENST00000495267 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.3■■■■■ 4.2
KMT2E-214ENST00000495267 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
KMT2E-214ENST00000495267 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.26■■■■■ 4.2
KMT2E-214ENST00000495267 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.05■■■■■ 4.16
KMT2E-214ENST00000495267 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.77■■■■■ 4.12
KMT2E-214ENST00000495267 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.45■■■■■ 4.07
KMT2E-214ENST00000495267 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.4■■■■■ 4.06
KMT2E-214ENST00000495267 SCRIBQ14160 1630 aa40.23■■■■■ 4.03
KMT2E-214ENST00000495267 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.97■■■■□ 3.99
KMT2E-214ENST00000495267 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.96■■■■□ 3.99
KMT2E-214ENST00000495267 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
KMT2E-214ENST00000495267 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.22■■■■□ 3.87
KMT2E-214ENST00000495267 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.92■■■■□ 3.82
KMT2E-214ENST00000495267 SMARCA4P51532 1647 aa38.52■■■■□ 3.76
KMT2E-214ENST00000495267 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
KMT2E-214ENST00000495267 NCAPD3P42695 1498 aa38.35■■■■□ 3.73
KMT2E-214ENST00000495267 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.34■■■■□ 3.73
KMT2E-214ENST00000495267 SMARCA2P51531 1590 aa38.25■■■■□ 3.71
KMT2E-214ENST00000495267 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.22■■■■□ 3.71
KMT2E-214ENST00000495267 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.19■■■■□ 3.7
KMT2E-214ENST00000495267 HMGXB3Q12766 1538 aa38.16■■■■□ 3.7
KMT2E-214ENST00000495267 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
KMT2E-214ENST00000495267 WIZO95785 1651 aa37.79■■■■□ 3.64
KMT2E-214ENST00000495267 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
KMT2E-214ENST00000495267 NESP48681 1621 aa37.47■■■■□ 3.59
KMT2E-214ENST00000495267 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
KMT2E-214ENST00000495267 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.35■■■■□ 3.57
KMT2E-214ENST00000495267 ERCC6Q03468 1493 aa37.27■■■■□ 3.56
KMT2E-214ENST00000495267 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.18■■■■□ 3.54
KMT2E-214ENST00000495267 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.04■■■■□ 3.52
KMT2E-214ENST00000495267 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.04■■■■□ 3.52
KMT2E-214ENST00000495267 CUX2O14529 1486 aa37.03■■■■□ 3.52
KMT2E-214ENST00000495267 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
KMT2E-214ENST00000495267 CFTRP13569 1480 aa36.96■■■■□ 3.51
KMT2E-214ENST00000495267 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.92■■■■□ 3.5
KMT2E-214ENST00000495267 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.75■■■■□ 3.47
KMT2E-214ENST00000495267 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.71■■■■□ 3.47
KMT2E-214ENST00000495267 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.71■■■■□ 3.47
KMT2E-214ENST00000495267 PRDM2Q13029 1718 aa36.71■■■■□ 3.47
KMT2E-214ENST00000495267 WDR62O43379 1518 aa36.64■■■■□ 3.46
KMT2E-214ENST00000495267 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
KMT2E-214ENST00000495267 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
KMT2E-214ENST00000495267 TOPBP1Q92547 1522 aa36.17■■■■□ 3.38
KMT2E-214ENST00000495267 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.12■■■■□ 3.37
KMT2E-214ENST00000495267 ABCC8Q09428 1581 aa36.11■■■■□ 3.37
KMT2E-214ENST00000495267 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.06■■■■□ 3.36
KMT2E-214ENST00000495267 IFT140Q96RY7 1462 aa35.96■■■■□ 3.35
KMT2E-214ENST00000495267 CUX1P39880 1505 aa35.86■■■■□ 3.33
KMT2E-214ENST00000495267 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
KMT2E-214ENST00000495267 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
KMT2E-214ENST00000495267 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
KMT2E-214ENST00000495267 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.73■■■■□ 3.31
KMT2E-214ENST00000495267 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
KMT2E-214ENST00000495267 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.68■■■■□ 3.3
KMT2E-214ENST00000495267 SOGA1O94964 1423 aa35.65■■■■□ 3.3
KMT2E-214ENST00000495267 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.59■■■■□ 3.296e-7■■■□□ 15.2
KMT2E-214ENST00000495267 WDR97A6NE52 1622 aa35.53■■■■□ 3.28
KMT2E-214ENST00000495267 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.52■■■■□ 3.28
KMT2E-214ENST00000495267 TOP2BQ02880 1626 aa35.5■■■■□ 3.27
KMT2E-214ENST00000495267 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.5■■■■□ 3.27
KMT2E-214ENST00000495267 SYNJ1O43426 1573 aa35.49■■■■□ 3.27
KMT2E-214ENST00000495267 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
KMT2E-214ENST00000495267 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.4■■■■□ 3.26
KMT2E-214ENST00000495267 OSCARQ8IYS5 282 aa35.38■■■■□ 3.25
KMT2E-214ENST00000495267 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.3■■■■□ 3.24
KMT2E-214ENST00000495267 CHD1O14646 1710 aa35.29■■■■□ 3.24
KMT2E-214ENST00000495267 GRIN2BQ13224 1484 aa35.28■■■■□ 3.24
KMT2E-214ENST00000495267 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.26■■■■□ 3.23
KMT2E-214ENST00000495267 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.26■■■■□ 3.23
KMT2E-214ENST00000495267 PBRM1Q86U86 1689 aa35.24■■■■□ 3.23
KMT2E-214ENST00000495267 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
KMT2E-214ENST00000495267 SYNJ2O15056 1496 aa35.08■■■■□ 3.21
KMT2E-214ENST00000495267 FBLN2P98095 1184 aa35.05■■■■□ 3.2
KMT2E-214ENST00000495267 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
KMT2E-214ENST00000495267 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.96■■■■□ 3.19
KMT2E-214ENST00000495267 ADAMTS12P58397 1594 aa34.96■■■■□ 3.19
KMT2E-214ENST00000495267 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.94■■■■□ 3.18
KMT2E-214ENST00000495267 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.94■■■■□ 3.18
KMT2E-214ENST00000495267 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.94■■■■□ 3.18
KMT2E-214ENST00000495267 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.93■■■■□ 3.18
KMT2E-214ENST00000495267 ARHGEF11O15085 1522 aa34.9■■■■□ 3.18
KMT2E-214ENST00000495267 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.84■■■■□ 3.17
KMT2E-214ENST00000495267 GRIN2AQ12879 1464 aa34.84■■■■□ 3.17
KMT2E-214ENST00000495267 KIF27Q86VH2 1401 aa34.75■■■■□ 3.15
KMT2E-214ENST00000495267 NUP160Q12769 1436 aa34.73■■■■□ 3.15
KMT2E-214ENST00000495267 CEP170Q5SW79 1584 aa34.7■■■■□ 3.15
KMT2E-214ENST00000495267 TRIM41Q8WV44 630 aa34.7■■■■□ 3.15
KMT2E-214ENST00000495267 IGF1RP08069 1367 aa34.68■■■■□ 3.14
KMT2E-214ENST00000495267 ARAP1Q96P48 1450 aa34.63■■■■□ 3.13
KMT2E-214ENST00000495267 CUL7Q14999 1698 aa34.6■■■■□ 3.13
KMT2E-214ENST00000495267 SHROOM2Q13796 1616 aa34.52■■■■□ 3.12
KMT2E-214ENST00000495267 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.48■■■■□ 3.11
KMT2E-214ENST00000495267 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.46■■■■□ 3.11
KMT2E-214ENST00000495267 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.44■■■■□ 3.1
KMT2E-214ENST00000495267 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms