Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
ARFGEF2Q9Y6D5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARFGEF2Q9Y6D5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms