Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX13Q9Y5W8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX13Q9Y5W8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX13Q9Y5W8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX13Q9Y5W8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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