Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTP11Q9Y3A2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UTP11Q9Y3A2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP11Q9Y3A2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms