Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX24Q9Y343 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX24Q9Y343 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX24Q9Y343 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX24Q9Y343 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX24Q9Y343 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX24Q9Y343 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX24Q9Y343 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX24Q9Y343 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX24Q9Y343 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX24Q9Y343 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX24Q9Y343 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX24Q9Y343 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX24Q9Y343 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms