Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP11BQ9Y2G3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP11BQ9Y2G3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP11BQ9Y2G3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP11BQ9Y2G3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms