Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
THSD7AQ9UPZ6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
THSD7AQ9UPZ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
THSD7AQ9UPZ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
THSD7AQ9UPZ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms