Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCOR1Q9UKL0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCOR1Q9UKL0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCOR1Q9UKL0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.5 ms