Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PFDN2Q9UHV9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PFDN2Q9UHV9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PFDN2Q9UHV9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms