Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1BQ9UEU0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VTI1BQ9UEU0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms