Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
APEX2Q9UBZ4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APEX2Q9UBZ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APEX2Q9UBZ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms