Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDH10Q9P2E7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCDH10Q9P2E7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDH10Q9P2E7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms