Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0B6

CCDC167, Coiled-coil domain-containing protein 167, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC167Q9P0B6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC167Q9P0B6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC167Q9P0B6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC167Q9P0B6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC167Q9P0B6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms