Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI5

GRHL1, Grainyhead-like protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL1Q9NZI5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRHL1Q9NZI5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRHL1Q9NZI5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRHL1Q9NZI5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRHL1Q9NZI5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRHL1Q9NZI5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRHL1Q9NZI5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRHL1Q9NZI5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms