Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RDH8Q9NYR8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH8Q9NYR8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH8Q9NYR8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms