Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSD3Q9NYI0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSD3Q9NYI0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms