Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAH9Q9NYC9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAH9Q9NYC9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DNAH9Q9NYC9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms