Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
TRMT1Q9NXH9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRMT1Q9NXH9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRMT1Q9NXH9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms