Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCFC1R1Q9NWW0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCFC1R1Q9NWW0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms