Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC7

ST6GALNAC1, Alpha-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST6GALNAC1Q9NSC7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ST6GALNAC1Q9NSC7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ST6GALNAC1Q9NSC7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ST6GALNAC1Q9NSC7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ST6GALNAC1Q9NSC7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ST6GALNAC1Q9NSC7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ST6GALNAC1Q9NSC7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms