Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASS4Q9NQ75 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASS4Q9NQ75 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASS4Q9NQ75 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms