Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRHQ9HD43 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRHQ9HD43 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRHQ9HD43 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRHQ9HD43 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRHQ9HD43 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRHQ9HD43 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRHQ9HD43 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRHQ9HD43 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRHQ9HD43 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRHQ9HD43 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRHQ9HD43 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms