Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM49AQ9H0Q0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM49AQ9H0Q0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM49AQ9H0Q0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms