Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms