Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms