Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT3Q9BYD9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT3Q9BYD9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms