Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED9Q9BVK6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED9Q9BVK6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms