Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSRP1Q9BUV0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSRP1Q9BUV0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms