Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM208Q9BTX3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms