Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRADC1Q9BSG0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms