Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLF1Q9BQI6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLF1Q9BQI6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms