Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3GL3Q99963 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3GL3Q99963 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms