Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT1Q99946 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT1Q99946 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms