Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPAS2Q99743 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPAS2Q99743 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPAS2Q99743 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms