Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HAPLN3Q96S86 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HAPLN3Q96S86 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HAPLN3Q96S86 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HAPLN3Q96S86 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HAPLN3Q96S86 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HAPLN3Q96S86 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HAPLN3Q96S86 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HAPLN3Q96S86 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HAPLN3Q96S86 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HAPLN3Q96S86 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HAPLN3Q96S86 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HAPLN3Q96S86 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN3Q96S86 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms