Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERGIC2Q96RQ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERGIC2Q96RQ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERGIC2Q96RQ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERGIC2Q96RQ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERGIC2Q96RQ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERGIC2Q96RQ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERGIC2Q96RQ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERGIC2Q96RQ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ERGIC2Q96RQ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERGIC2Q96RQ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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