Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNGAP1Q96PV0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYNGAP1Q96PV0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNGAP1Q96PV0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNGAP1Q96PV0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms