Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPOR3Q96MK2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIPOR3Q96MK2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPOR3Q96MK2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPOR3Q96MK2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPOR3Q96MK2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPOR3Q96MK2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIPOR3Q96MK2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIPOR3Q96MK2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIPOR3Q96MK2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIPOR3Q96MK2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIPOR3Q96MK2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIPOR3Q96MK2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIPOR3Q96MK2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms