Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf85Q96MD7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms